Oluline on eristada ägedat ja kroonilist kõhulahtisust, lokaliseerida probleem peen- või jämesooles ning mõista, kas kõhulahtisus on tingitud esmasest seedetrakti haigusest või on see soolevälise haiguse tagajärg.
Arvestades kõhulahtisuse erinevaid põhjuseid ja selle potentsiaalselt iseenesest piiravat iseloomu, peaks diagnostiline lähenemisviis varieeruma sõltuvalt patsiendi kliinilisest ajaloost, sümptomite tõsidusest ja omaniku kättesaadavusest.
on kõige levinumad põhjused. Nendel juhtudel on haiguslugu väga oluline (kokkupuude haigete loomadega, teadaolev talumatus, kennelites viibimine, alatoidetud või riknenud toidu tarbimine).Lima, elus veri, defekatsiooni raskus ja kiireloomulisus viitavad jämesoole probleemile, kaalulangus ja seeditud vere olemasolu viitavad aga peensoole haigestumisele.
Kerge kõhulahtisusega, normaalse toidu- ja veetarbimisega loomade puhul, kellel puudub oksendamine või dehüdratsioon, piisab sageli toetavast hooldusest. Kliiniliste tunnuste progresseerumise korral, millega kaasneb dehüdratsioon ja isutus, on vaja täiendavaid diagnostilisi teste, nagu väljaheite, nakkushaiguste ja vereanalüüside testid, pöörates erilist tähelepanu süsteemsete haiguste tunnustega loomadele.
Kõhulahtisust kaasloomadel on seostatud Clostridium perfringens, Clostridium difficile, Campylobacter, Salmonella ja E. coli haigustega. Teisest küljest sisaldavad aga paljud terved loomad neid baktereid ja nende leidmine ei tähenda tingimata kliiniliste tunnuste olemasolu.
Eelkõige on nende vahel ilmne seos C. perfringens ja äge hemorraagiline kõhulahtisus, kuid ei ole selge, kas selle bakteri olemasolu on põhjus või tagajärg, mis on tingitud "soole mikrofloora muutumisest; sama kehtib ka C. raske.
Seevastu Campylobacter võib põhjustada seedetrakti sümptomeid, eriti noortel loomadel, kes puutuvad kokku selliste eelsoodumustega nagu stress, ülerahvastatus ja kaasnevad haigused.
Mõned tüübid E. coli võib põhjustada sooleinfektsioone nõrgenenud immuunsüsteemiga koertel ja on sageli seotud Boxeri granulomatoosse koliidiga, sarnaseid kahjustusi on kirjeldatud ka prantsuse buldogis ja bordercollies.
