Tervete ja hästi hüdreeritud isikute uriinilõhn on tavaliselt "sui generis" ja ei sisalda halbu lõhnaaineid. Tegelikult räägime tavaliselt aseptilisest vedelikust, mis sisaldab muutuvaid kontsentratsioone jäätmeid sõltuvalt toitumisest, tervislikust seisundist ja hüdratsioon ja mis tahes ravimite võtmine.
Halb lõhn uriinis võib seega olla märk patoloogilistest seisunditest, kuid mitte tingimata.
(mis muudavad ka värvi, liigutades seda helerohelise poole), lillkapsa ja küüslauguga kaasneb tavaliselt ebameeldiva lõhnaga uriin.(kuna halva lõhna eest vastutavad lahustunud ained suurendavad nende kontsentratsiooni; uriin omandab seega eriti tumeda värvuse ja iseloomuliku ammoniaagi aroomi);
Põiepõletik, kuseteede infektsioonid, püelonefriit (neeruinfektsioonid), uretriit, prostatiit ja tupepõletik (antud juhul ei pruugi probleem olla kuseteedega seotud, arvestades anatoomilist lähedust - lisateabe saamiseks vt: tupe lõhn);
Maksapuudulikkus;
Diabeetiline ketoatsidoos ja ketonuuria (tüüpiline ka pikaajalisele tühja kõhuga, millega kaasneb rikkalik magusa lõhnaga uriin, sarnane atsetooniga);
Rektovaginaalne fistul;
Fenüülketonuuria (harvaesinev haigus alates sünnist);
Vitamiin B-6 toidulisandite võtmine
Ainevahetushäired;
Vahtrasiirupi uriinihaigus (harv);
Trimetüülaminuuria või kalalõhna sündroom (harva);
Mõned ravimid võivad muuta ka uriini lõhna, sealhulgas mõned antibiootikumid, nagu amoksitsilliin, ampitsilliin, nitrofurantoiin, tsiprofloksatsiin, norfloksatsiin, ofloksatsiin ja trimetoprim.
Halva uriinilõhna põhjuseid saab uurida lihtsa uriinianalüüsi ja kultuuri abil (bakteriaalsete infektsioonide otsimiseks).