ja nakkuse leviku viisid võivad olla erinevad. Patogeenide vahendatud koloniseerimine võib tegelikult toimuda järgmiselt:
- Tõusev tee põiest (kõige sagedasem): perineumist (või naissoost patsientide puhul tupe eesruumist) tõusevad mikroorganismid kusejuhasse, seejärel põide, kuni neeruni; peamised põhjused Naiste nakkushaigus seisneb kusiti deformatsioonis seksuaalvahekorra ajal, samas kui meestel on see sageli prostatiidi tagajärg. Kateteriseeritud patsientidel võib pärast kateetri paigutamist või manipuleerimist tekkida saastumine, mille tagajärjel võivad patogeenid kusepõie sattuda. .
- Vere laskumine: vereringe kaudu satuvad patogeenid septitseemia käigus neerudesse, põhjustades neerupõletikku ja neerupaise.
- Kahanev lümfitee: lümfisoonte võrk ühendab tõusva käärsoole parema neeruga ja kahaneva käärsoole vasaku neeruga.
Püelonefriidiga seotud mikroorganismid vastutavad tavaliselt kuseteede, suguelundite ja seedetrakti infektsioonide eest, seega põies, eesnäärmes, emakakaelas, tupes, kusiti või pärasooles: Escherichia coli, Klebsiella spp., Proteus spp., Enterococcus spp. jne.
Enamikul juhtudel kujutavad need patogeenid väljaheitefloora baktereid, mis läbivad tõusuteed, kuigi üldiselt teostab peristaltika (kontraktsioonide liikumine ja kuseteede seinte laienemine) "tõhusat kaitset infektsioonide vastu.
Aeg -ajalt teatatakse teistest ebatavalistest mikroorganismidest: mükobakterid, pärmid ja seened, samuti oportunistlikud patogeenid nagu Corynebacterium urealyticum.